论著
李富雨, 王家军, 冷珺, 李柳醒, 黄洁, 张俊玫, 周艳, 李章, 余俊, 郑亚雄, 於倩, 王佳丽, 王静林
目的 了解云南省西双版纳边境地区柯萨奇病毒A16型(Coxsackievirus A16, CVA16)分子特征与国内外流行毒株的进化关系,为西双版纳地区CVA16感染防治及分子溯源提供科学依据。方法 2024年12月在西双版纳州景洪市第一人民医院采集临床诊断为疑似手足口病儿童的咽拭子样本,提取病毒核酸,采用巢式RT-PCR扩增病毒VP1区基因序列,使用MEGA 7.0等生物信息学软件进行序列分析。结果 共采集到36份疑似手足口病儿童的咽拭子样本;CVA16-VP1特异引物扩增3份阳性(样本编号:3/JH-YN/2025、5/JH-YN/2025、6/JH-YN/2025),CVA16检出率为8.33%。序列分析结果显示,本研究获得3条序列与2022—2023年中国江西省流行的 B1a基因亚型CVA16位于同一进化分支内,核苷酸同源性均在89%以上,氨基酸同源性均在92%以上;而其他基因亚型CVA16病毒位于不同进化分支内,核苷酸同源性低于89%,氨基酸同源性低于90%,提示本次景洪市12月份流行的手足口病病毒以CVA16 B1a基因亚型为主要流行基因亚型病毒;氨基酸位点分析发现,景洪市3株阳性株符合当前新型B1a基因VP1-164K/251I流行模式,16个易突变位点中有4个发生突变。第145位氨基酸未发生突变,符合E145V。第252、261位产生个体株特异性位点突变,3株阳性株第266位均出现特异性位点突变。结论 2024年12月西双版纳州景洪市存在CVA16-B1a流行基因亚型流行,本次流行毒株与近年来在云南其他地区和江西流行的毒株密切相关。研究结果为该地区手足口病的诊断及预防提供科学依据。