目的 比较抗结核预防性治疗药物不良反应发生与miRNA的相关性,通过对比服药前的miRNA表达差异来探索miRNA对药物不良反应的预测价值。方法 以2022年10月—2023年10月在中国东部某监狱接受预防性治疗的女性新进羁押人员为研究对象,通过结构化问卷收集研究对象人口学特征、行为危险因素、既往疾病史等信息。预防性服药者于服药前(基线)及服药后第1、2、3个月末定期随访并记录药物不良反应。按照1∶2随机匹配未发生药物不良反应的服药者为对照组。采集病例组与对照组服药前(基线)的血清样本开展miRNA测序,结合GO及KEGG功能富集分析药物不良反应的相关功能和通路。结果 研究共纳入符合预防性服药对象187人,88人(47.06%)完成疗程,其中出现药物不良反应28人。以简单随机方法选取13人为病例组,根据一般人口学特征匹配对照组26人。病例组中肝功能异常最为常见,占84.61%(11/13)。共36名研究对象(病例组13人,对照组23人)的血清样本成功进行了miRNA测序分析。组间差异表达miRNA 102个,其中差异表达上调的miRNA有33个,表达下调的差异miRNA有69个。靶基因显著富集的生物学过程主要包括主要参与DNA模板转录的负向调节、半胱素-脉络蛋白信号通路、线粒体自噬等生物过程;在分子功能上富集于序列特异性双链DNA结合、蛋白质自关联、DNA结合转录因子活性以及乙酰胆碱受体活性等。显著富集的KEGG通路涉及催产素信号通路与胰岛素分泌、胆碱能突触、肥厚型心肌病、扩张型心肌病等过程通路。结论 抗结核预防性服药对象中药物不良反应较为常见,特别是肝功能异常;关注富集的生物过程及信号通路能够为用药评估与用药方案的调整提供可参考依据。
目的 获得结核分枝杆菌BfrB重组蛋白并研究其自组装和免疫学特性,为开发新型结核病亚单位疫苗提供思路。方法 将BfrB基因克隆入pET28a(+),重组质粒转化E. coli感受态细胞;表达菌株经IPTG 16 ℃诱导后通过Western blot鉴定BfrB重组蛋白表达,用亲和层析法纯化目的蛋白。透射电镜和非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳鉴定BfrB多聚体结构。BfrB蛋白经肌肉免疫小鼠3次,间接ELISA法检测血清抗体水平,CCK-8法检测小鼠脾细胞增殖情况,双抗夹心ELISA法检测脾细胞分泌细胞因子水平。结果 成功构建了BfrB原核表达载体pET28a(+)-BfrB。将该载体转化至表达菌株后进行IPTG诱导。Western Blot鉴定结果显示,成功表达蛋白分子量约为22 kDa的目的蛋白。经亲和层析法获得纯化的BfrB重组蛋白,浓度为0.8 mg/mL。非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳显示纯化的BfrB自发形成大分子多聚体,透射电镜观察发现其可自组装形成规则的直径10nm的纳米颗粒。BfrB免疫可诱导小鼠产生高水平特异性IgG,滴度为1∶51 200;并显著促进小鼠脾细胞增殖。经BfrB重组蛋白和Mtb菌体蛋白刺激后,免疫小鼠脾细胞分泌IFN-γ、IL-10水平较未免疫组均显著升高,经BfrB重组蛋白刺激后免疫小鼠脾细胞分泌IL-2水平较未免疫组显著升高。上述结果表明,BfrB蛋白免疫可诱导小鼠产生强烈的体液免疫,并能同时引发Th1与Th2型细胞免疫应答。结论 重组BfrB蛋白具有自组装特性和较强的免疫原性,能够诱导小鼠较强的体液和细胞免疫应答。本研究为TB新型亚单位疫苗的研制奠定了理论基础。
目的 分析江苏省耐多药/利福平耐药结核病(multidrug-resistant tuberculosis/rifampicin-resistant tuberculosis, MDR/RR-TB)的发病、死亡和治疗趋势,为优化结核病防控提供科学依据。方法 收集“中国结核病信息管理系统”中2009—2023年江苏省MDR/RR-TB数据,计算年龄标化发病率(age-standardized incidence rate, ASIR)、年龄标化死亡率(age-standardized mortality ratio, ASMR)、病死率(case-fatality rate, CFR)和治疗率,使用Joinpoint回归模型的年度变化百分比(annual percentage change, APC)和平均年度变化百分比(average annual percentage change, AAPC)描述变化趋势。采用年龄-时期-队列模型(age-period-cohort model, APC模型)估计发病和死亡的年龄、时期和队列效应。结果 2023年江苏省MDR/RR-TB的ASIR为0.65/10万、ASMR为0.038/10万,较2009年均上升,AAPC分别为11.24%和6.97%。男性ASIR(AAPC=10.50%,P=0.002)和ASMR(AAPC=7.94%,P=0.004)呈上升趋势,CFR(AAPC=-1.82,P=0.601)以及女性ASIR(AAPC=13.98%,P=0.056)和ASMR(AAPC=1.95%,P=0.494)趋势无统计学意义。苏南ASIR增幅(AAPC=17.66%)高于苏中(AAPC=4.40%)和苏北(AAPC=14.33%)。治疗率逐步上升达100.00%,其中女性、初治者和苏北的AAPC分别为1.90%、3.47%和3.45%。APC模型显示,发病率(净漂移=8.69%)和死亡率(净漂移=5.64%)均随年龄增长而递增,分别在75~79岁(7.41/10万)和80~84岁(2.77/10万)达到峰值;发病和死亡风险随时期推移分别升至1.23和1.45;发病风险随出生队列升高,2004年为峰值(RR=26.24),而死亡风险队列效应相对平缓。结论 2009—2023年江苏省MDR/RR-TB的发病率和死亡率呈上升趋势,治疗率保持较高水平,男性、苏南和老年人负担突出,针对重点人群实施精准防控策略是未来遏制疫情的关键。
目的 通过实验和生物信息学分析,初步探究Rv0305c(PPE6)蛋白在结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis, Mtb)致病过程中的作用,为深入阐明其作用机制及发现抗结核药物新靶点奠定基础。方法 基于CRISPR-Cas 辅助的非同源末端连接基因编辑技术在Mtb H37Rv野生株(wild type,WT)中构建Rv0305c基因敲除株(ΔRv0305c),进而电转入Rv0305c表达载体构建基因敲除回补株(ΔRv0305c::Rv0305c);采用扫描电镜分析Mtb菌株形态;通过紫外可见分光光度计测定培养菌液OD600值并绘制生长曲线;采用逆转录定量PCR动态分析3种菌株感染THP-1巨噬细胞后炎症相关细胞因子的表达差异;分别采用AlphaFold进行蛋白质三维结构建模、STRING进行互作网络分析、SignalP预测信号肽、DeepTMHMM预测跨膜结构、InterPro分析家族和结构域、DeepLocPro分析亚细胞定位以及ELM分析真核样短线性模体。结果 成功构建了ΔRv0305c 和ΔRv0305c::Rv0305c菌株。Rv0305c基因敲除后不影响Mtb的形态和生长速度,但ΔRv0305c相比WT和ΔRv0305c::Rv0305c能诱导巨噬细胞在感染后2 、24、48 h产生更多IL-6和TNF-α,与此同时诱导产生更少的IL-10(P<0.05)。生物信息学分析显示:Rv0305c与PPE5在基因组中紧密相邻且转录方向一致,Rv0305c蛋白属于富含谷氨酰胺蛋白2家族,具有特定结构域,三维结构模型置信度平均分值为78.19,互作网络蛋白包括多个PE/PPE家族成员以及CpnT、Rv2082和Rv1004c,Rv0305c蛋白可能含有真核样短线性模体,其本身不含信号肽、为非跨膜胞外球蛋白,定位于胞外的概率最大(0.721 8)。结论 Rv0305c蛋白能够协助Mtb抑制感染巨噬细胞的炎症反应,该蛋白被预测为真核样非典型分泌蛋白。
目的 了解云南省结核分枝杆菌对利福平(rifampicin, RIF)和利福布汀(rifabutin, RFB)交叉耐药情况及其相关机制,为RIF耐药结核患者的RFB替代治疗提供参考依据。方法 对云南省疾病预防控制中心在2022年1—12月分离获得的云南省348株结核分枝杆菌进行最低抑菌浓度(minimum inhibitory concentration,MIC)法药敏试验和全基因组测序,分析对RIF和RFB交叉耐药情况及其获得菌株的耐药基因突变特征。结果 348株结核分枝杆菌中,MIC法药物敏感性试验检出RIF或RFB耐药89株,其中RIF和RFB同时耐药63株,RIF耐药、RFB敏感25株,RIF敏感、RFB耐药1株,RIF和RFB交叉耐药率为70.79%(63/89)。348株结核分枝杆菌中,全基因组测序检出发生rpoB基因突变88株,rpoB基因516、526和531位点突变菌株RIF和RFB耐药率分别占100.00%(6/6)和33.33%(2/6)、94.12%(16/17)和76.47%(13/17),100.00%(37/37)和97.30%(36/37),均表现较高的耐药率。结论 在云南省接近30%的RIF耐药患者可使用RFB治疗,rpoB 511、516、522、533等位点突变与RFB耐药相关性较差,当检测到发生这些突变的时候可以选择使用RFB治疗,rpoB 526、531等位点突变与RIF和RFB耐药的相关性均较好,当发生这些突变时,RIF和RFB用于治疗将受影响。
目的 系统分析淮安市结核病患者就诊延迟的核心影响因素,构建高精准度的就诊延迟预测模型,为江苏北部农业地区优化结核病防控策略提供流行病学依据。方法 以2015—2024年淮安市结核病管理信息系统登记的17 169例患者为研究对象,采用卡方检验、t检验进行基线与临床特征比较,通过多因素logistic回归分析明确就诊延迟的独立影响因素;同时运用随机森林(random forest, RF)、AdaBoost分类(adaptive boosting classification, AdaBoost)、梯度提升树(gradient boosting decision tree, GBDT)等6种机器学习算法构建预测模型,结合准确率、曲线下面积(area under the curve, AUC)等指标评估模型性能。结果 淮安市结核病患者就诊延迟率为67.0%(11 496/17 169)。多因素logistic回归显示,实际服药管理方式[家庭成员管理vs医务人员管理:比值比(odds ratio, OR)=1.598(95%CI:1.159~2.203),P=0.004]、治疗模式[门诊治疗vs非门诊治疗:OR=4.129(95%CI:1.227~13.888),P=0.022]及症状模式(咯血相关:OR=0.172,P<0.001;无症状:OR=0.142,P<0.001)是就诊延迟的独立影响因素,而年龄、性别等人口学特征的影响无统计学意义。机器学习模型中,GBDT综合性能最优,准确率达0.948,AUC值为0.993,显著优于其他算法。结论 实际服药管理方式、治疗模式及症状模式是影响淮安市结核病患者就诊时机的关键因素,本研究成功构建了6种机器学习算法模型,尤其是基于GBDT算法构建的预测模型可实现就诊延迟风险的精准评估,为区域结核病精准防控提供技术支撑。
目的 探索空气污染物二氧化硫(sulfur dioxide, SO2)、二氧化氮(nitrogen dioxide, NO2)、可吸入颗粒物(inhalable particles, PM10)、细颗粒物(fine particulate matter, PM2.5)、一氧化碳(carbon monoxide, CO)和臭氧(ozone, O3)暴露与学生肺结核病(pulmonary tuberculosis, PTB)发病风险之间的关联,为制定针对学生群体的结核病环境风险防控策略提供科学依据。方法 收集2014—2024年江苏省13个地级市学生PTB患者基本信息、室外空气污染物和气象因素的数据。采用广义相加模型评估空气污染物暴露对学生PTB发病风险的影响,并采用双污染物模型和以城市为随机效应的广义相加混合模型进行敏感性分析。同时采用限制性立方样条函数拟合暴露反应曲线,检验剂量反应关系的线性假设。结果 2014—2024年,江苏省13个地级市报告了11 084例新诊断的学生肺结核病例。NO2、PM10、PM2.5和O3浓度每增加10个单位,PTB风险分别在滞后0、6、5和5周的时间下增加12.41%(95%CI: 7.07%~18.02%)、9.19%(95%CI: 4.32%~14.29%)、9.83%(95%CI: 5.07%~14.81%)和10.04%(95%CI: 4.27%~16.12%)。在敏感性分析中,这些关联仍然稳健。暴露反应曲线显示,NO2、PM2.5和O3与PTB发病风险呈近似线性的正相关关系,PM10与PTB发病风险总体呈正相关关系,但在低浓度范围内曲线相对平缓,中高浓度范围内风险增加更为明显。结论 江苏省学生暴露于NO2、PM10、PM2.5和O3可增加PTB发病风险。学生是空气污染相关PTB的易感群体,采取综合防控措施控制室外空气污染物浓度可能有助于降低学生群体结核病疾病负担。
目的 揭示青海省结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis, Mtb)的群体结构、耐药特征及传播动态,为该地区高负担结核病精准防控提供分子流行病学依据。方法 纳入2015—2024年间青海省194例结核病患者临床分离菌株,采用全基因组测序(whole genome sequencing, WGS)技术,通过核心基因组单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP)分析,对菌株进行谱系分型、耐药基因突变检测,并构建系统发育树以评估遗传聚类和近期传播事件。结果 青海省Mtb菌株总体耐药率为30.4%(59/194),其中单耐药、耐多药(multidrug-resistant tuberculosis, MDR-TB)和准广泛耐药(pre-extensively drug-resistant tuberculosis, Pre-XDR-TB)分别占21.6%、4.1%和0.5%,以链霉素耐药率最高(15.5%)。群体遗传结构分析显示,谱系2(L2)是绝对优势谱系(83.2%,159/191),其中L2.2.1亚谱系最为流行(66.5%)。WGS检测出启动子区突变、非同义突变(氨基酸改变)和同义突变(核苷酸改变),以rpsL、katG和rpoB基因突变为主。WGS耐药突变检测结果与临床治疗结局显著相关(P<0.05)。基于SNP遗传距离≤12的遗传聚类分析识别出16个传播簇,涵盖57株菌株,总聚类率为29.4%。多因素分析表明,Pre-XDR-TB菌株较敏感菌株更易形成传播簇(P<0.05),且2015—2017年的分离株成簇率显著高于2023—2024年。结论 青海省Mtb流行以L2谱系克隆传播为主导,患者对常用抗结核药物耐药性高,突变类型多样。需重点关注菌株的近期传播特征,为制定“簇水平干预”精准防控策略提供依据。
目的 探讨活动性肺结核(active pulmonary tuberculosis, ATB)和结核潜伏感染(latent tuberculosis infection, LTBI)者外周血自然杀伤(natural killer, NK)细胞及其亚群(CD56+CD16+、CD56+CD16-、CD56-CD16+)的分布特点,并分析不同痰菌载量对ATB患者外周血NK细胞及其亚群分布的影响。方法 收集2024—2025年北京市疾病预防控制中心门诊272例符合纳入排除标准的研究对象的外周血样本,其中健康对照(healthy control, HC)组100 例、ATB组72 例、LTBI组100例。采用流式细胞术检测外周血总NK细胞百分率及各亚群占总NK细胞的比例;另将62例痰Xpert检测阳性ATB患者按痰菌载量分为极低、低、中、高4组,分析各组外周血NK细胞及亚群的分布差异。结果 LTBI组总NK细胞占比高于HC组(q=8.498,P<0.000 1)及ATB组(q=4.846,P=0.002 0),而HC组与ATB组比较,差异无统计学意义(P>0.05)。亚群分析显示,LTBI组CD56+CD16+占比高于HC组(Z=5.015,P<0.000 1)和ATB组(Z=2.402,P=0.048 9);ATB 组与LTBI组CD56+CD16-亚群占比比较,差异无统计学意义(Z=0.1916, P>0.05),但2组该亚群占比均低于HC组(ATB vs HC:Z=4.958,P<0.000 1;LTBI vs HC:Z=5.628,P<0.000 1),差异均有统计学意义;LTBI组CD56-CD16+占比低于HC组(Z=2.507,P=0.036 5),ATB 组该亚群占比与HC组、LTBI组比较,差异均无统计学意义(P>0.05)。不同痰菌载量的ATB患者间, 外周血总NK细胞及各亚群占比差异均无统计学意义(P>0.05)。结论 结核分枝杆菌感染状态可影响外周血NK细胞及其亚群的分布特征,而ATB患者的痰菌载量与NK细胞免疫表型未见明显相关性。
目的 探讨海南省肺结核发病的时空特征及其相关因素,为制定海南省肺结核防控策略提供参考依据。方法 整合2014—2023年海南各市县肺结核报告病例、气象、社会经济和卫生资源资料,构建5个层次递进的贝叶斯时空模型,逐步引入时空效应,采用集成嵌套拉普拉斯逼近(integrated nested Laplace approximation, INLA)算法进行贝叶斯推断,并依据偏差信息准则(deviance information criterion, DIC)、渡边赤池信息准则(Watanabe-Akaike information criterion, WAIC)和条件预测纵坐标(conditional predictive ordinates, CPO)选择最优模型,对肺结核发病的时空特征及影响因素进行分析。结果 2014—2023年海南省各市县结核病发病风险存在空间异质性,模型估计的相对风险值范围为0.840~1.580,发病相对风险整体呈现东南沿海最高、西部次之、北部及中南部普遍较低的分布特征。2014—2023年发病年度相对风险围绕基准线低幅振荡,范围为0.968~1.029;月度相对风险则呈现季节特征,在1月和3月达到冬春季高峰,而在夏季的8、9月以及12月则降至基准以下。时空交互效应分析显示,全省肺结核发病风险整体呈下降趋势,区域间风险差异缩小。影响因素分析显示,气温(RR=0.988, 95%CI: 0.978~0.997)与气压(RR=0.994, 95%CI: 0.991~0.998)为保护因素,日照时数(RR=1.002, 95%CI: 1.001~1.003)是危险因素,农村人均纯收入为有统计学意义的保护因素,但其效应量极小。结论 海南省肺结核发病呈现明显的时空异质性,受气象和社会经济因素影响。建议实施差异化防控,建立气象响应机制,并在发病高峰季节加强干预,同时巩固农村防控基础,以发挥保护作用。
目的 分析1990—2021年我国人群囊尾蚴病疾病负担的变化,并预测2022—2035年我国人群囊尾蚴病疾病负担变化趋势,为我国人群囊尾蚴病的防控提供流行病学依据。方法 基于2021年全球疾病负担(global burden of disease, GBD)数据库,获取我国人群囊尾蚴病年龄标准化患病率(age-standardized prevalence rate, ASPR)和年龄标准化伤残调整寿命年率(age-standardized disability-adjusted life years rate, ASDR)及其95%不确定性区间(uncertainty interval, UI);利用Joinpoint回归模型分析1990—2021年我国人群囊尾蚴病疾病负担的变化趋势;构建年龄-时期-队列(age-period-cohort, APC)分析模型,评估年龄效应、时期效应和队列效应对1990—2021年我国人群囊尾蚴病疾病负担的影响;应用贝叶斯年龄-时期-队列模型(Bayesian age-period-cohort, BAPC)将ASPR和ASDR未来趋势变化预测至2035年。结果 1990年我国人群囊尾蚴病ASPR为56.00/10万(95%UI: 39.43~75.54),2021年该数据为35.19/10万(95%UI:24.27~49.00),下降37.16%。1990年我国囊尾蚴病ASDR为18.75/10万(95%UI:11.94~27.67),2021年该数据为8.56/10万(95%UI:4.99~13.71),下降54.35%。Joinpoint结果显示1990—2021年我国囊尾蚴病ASPR和ASDR均呈先上升、再持续下降、近年呈上升的趋势。APC分析模型表明年龄、时期和队列都是影响我国人群囊尾蚴病疾病负担的重要因素。BAPC模型预测显示2022—2035年我国人群囊尾蚴病疾病负担将呈上升趋势,其中女性增长幅度较男性更为显著。结论 我国人群囊尾蚴病疾病负担在1990—2021年间明显下降,但在近期及未来预测呈上升趋势,我国仍需进一步增加医疗资源的投入以应对囊尾蚴病的防控和诊疗。
目的 评估2019年海南省登革热患者的疾病与经济负担,并比较全国各省份登革热单位伤残调整寿命年(disability-adjusted life years, DALY)经济成本的差异,为量化登革热疾病与经济负担、制定区域精准的疾病防控策略和资源配置提供科学依据。方法 本研究采用回顾性分析,基于海南省人民医院2019年确诊的330例登革热患者的就诊信息,估算全省368例报告病例的疾病和经济负担。通过系统文献检索,汇总中国其他地区登革热经济负担数据,计算各省单位DALY经济成本,并比较地区间差异。结果 在330例登革热患者中,人均DALY负担为0.03人年,总经济负担的M(P25, P75)为1 822.11(162.61,2 601.74)元,其中直接经济负担的M(P25, P75)为1 513.03(162.61,2 144.84)元,间接经济负担的M(P25, P75)为219.28(0,438.56)元。2019年海南省登革热病例的全省总DALY负担为11.33人年。全省估计总经济负担为670 536.48 (95%UI: 575 537.30~751 654.70)元,其中直接经济负担为556 795.04 (95%UI: 488 810.70~626 089.40)元,间接经济负担为80 695.04 (95%UI: 53 797.92~107 592.20)元。全省估算单位DALY经济成本为59 182.39元。在我国登革热经济负担研究涉及的地区(广东、浙江、广西、云南和重庆)中,广东省的单位DALY经济成本和人均经济负担均为最高。结论 海南省登革热患者的经济负担严重,应通过扩大医保覆盖范围、完善异地医保结算来减轻患者的直接经济负担。全国各省间登革热患者的经济负担存在较大差异,因此登革热防控与补偿政策应结合区域特点,优化资源配置。
目的 调查云南省江城县秋季库蠓种类及库蠓中携带蓝舌病毒(Bluetongue Virus,BTV)、鹿流行性出血热病毒(epizootic hemorrhagic disease virus,EHDV)、西藏环状病毒(Tibet orbivirus,TIBOV,)、帕利亚姆血清群病毒(Palyam serogroup virus,PALV)情况。方法 2022年9—10月在江城县黄牛养殖舍采集库蠓,使用紫外诱捕灯在养殖舍悬挂1夜,次日清晨将捕捉的昆虫低温环境中带回实验室,在体视显微镜下根据库蠓翅斑形态鉴定库蠓种类,取代表性库蠓提取DNA,扩增线粒体细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ(COⅠ)基因并进行测序,通过NCBI BLAST比对,并构建系统发育树分析遗传进化关系;采用qRT-PCR检测库蠓中蓝舌病毒(BTV)、鹿流行性出血热病毒(EHDV)、帕利亚姆血清群病毒(PALV)、西藏环状病毒(TIBOV)4种病毒的核酸。结果 经体视显微镜观察,鉴别出条带库蠓(C.tainanus)、苏岛库蠓(C. sumatrae)、螫刺库蠓(C.spiculae)、棒须库蠓(C.clavipalpis)、抚须库蠓(C.palpifer)、褐肩库蠓(C.parahumeralis)等蠓种,其COⅠ基因序列与对应库蠓种类相似性超过98%,在系统发育树上与对应库蠓聚在一起,遗传关系较近;发现3只库蠓形态特征与褐肩库蠓、抚须库蠓相似,COⅠ基因序列分别与Culicoides kingi和褐肩库蠓相似性最高,为82.99%,在系统发育树上与褐肩库蠓和抚须库蠓处于不同进化分支,但均处于三囊亚属进化簇;从81份库蠓中检测到TIBOV和PALV核酸阳性各1份。结论 江城县秋季分布有条带库蠓、苏岛库蠓、螫刺库蠓、棒须库蠓、抚须库蠓、褐肩库蠓等蠓种,三囊亚属库蠓种群中存在尚未被很好认识的种类,江城县的库蠓中携带TIBOV和PALV。
目的 初步了解云南省玉溪市鼠类中巴尔通体的感染情况,为玉溪市巴尔通体的综合防控提供科学依据。方法 2024年在玉溪市8个县(市、区)区进行样本采集,利用荧光聚合酶链反应(polymerase chain reaction, PCR)方法确定样本巴尔通体是否阳性;选取Ct值小于30的样本,运用PCR方法扩增rpoB基因片段;通过Sanger测序测定扩增的rpoB基因片段序列,进行相似度比对并采用邻接法构建系统进化树,对测定序列进行系统进化分析。结果 共采集到215只鼠类的脏器组织样本215份,分别来自2属5种啮齿动物,褐家鼠为优势种(74.42%,160/215)。这些动物组织样本中巴尔通体总体阳性率为30.23%(65/215);其中,小家鼠样本阳性率为30.00%(3/10),黄胸鼠样本阳性率为26.19%(11/42),褐家鼠样本阳性率为31.25%(50/160),小家鼠、黄胸鼠、褐家鼠阳性率的差异无统计学意义(χ2=0.404,P>0.05)。8个县(市、区)均检测出巴尔通体阳性,不同地区阳性率差异有统计学意义(χ2=23.088,P<0.01),华宁县阳性率最高,为60.00%(18/30),澄江市阳性率最低,为13.33%(6/45)。对选取的19份Ct值小于30的阳性样本进行rpoB基因扩增并测定,经序列比对分析,共检测出4种巴尔通体,分别是特利波契巴尔通体(Bartonella tribocorum)10株,伊丽莎白巴尔通体(Bartonella elizabathae)2株,菲西巴尔通体(Bartonella phoceensis)1株,未定种巴尔通体6株。结论 玉溪市鼠类中至少存在4种巴尔通体,其中特利波契巴尔通体为主要流行菌种。
目的 了解陕西省2021—2024年霍乱弧菌对抗菌药物的耐药谱系及耐药基因分布规律,为临床治疗和公共卫生防控提供科学依据。方法 收集2021—2024年陕西省分离上报国家致病菌识别网的霍乱弧菌菌株149株资料,采用微量肉汤稀释法(MIC)进行药物敏感试验,利用细菌基因组提取试剂盒提取菌株DNA,采用Illumina MiniSeq测序平台进行二代全基因组测序,利用 Seqphere 10.0 5 软件AMRFinderPlus 3.11.26程序软件预测查询耐药基因,计算各类抗菌药物耐药率,分析菌株多重耐药情况,对耐药基因生成共现矩阵,利用Gephi 0.8.2进行耐药基因共现矩阵网络分析。结果 耐药率最高的是氨苄西林,耐药率49.66%,萘啶酸耐药率48.32%,阿奇霉素耐药率16.11%,全部菌株对替加环素敏感,多重耐药率41.61%(62/149),甲鱼样本多重耐药率最高76.74%(33/43),甲鱼分离菌株≥6类耐药率27.91%(12/43),3~5类耐药率48.84%(21/43),显著高于其他类型。全基因组分析预测耐药基因喹诺酮类有60株,占40.27%,其次是β-内酰胺类25株占16.78%。耐药基因与耐药表型不完全一致。耐药基因共现网络分析显示,floR和aph(3'')-Ib基因表现出最强的共现关系(权重=12),形成了网络的核心枢纽。gyrA_S83I(喹诺酮耐药)与多种β-内酰胺酶基因存在交叉共现。结论 陕西省环境中霍乱弧菌呈现高耐药性,甲鱼养殖系统是药物耐药性传播的关键,氯霉素和氨基糖苷类耐药基因可能存在协同传播,存在质粒介导的耐药基因水平转移现象。应建立水产养殖抗生素使用监测网络,严格控制水产养殖中非治疗性抗生素的使用。
目的 基于全基因组测序技术,解析皮疽诺卡菌对β-内酰胺类药物(头孢曲松、亚胺培南)耐药基因特征,探讨其耐药机制,为临床皮疽诺卡菌感染的精准用药提供依据。方法 收集2018年10月—2024年12月河北医科大学第二医院、河北省胸科医院、北京胸科医院临床分离的诺卡菌菌株,经基质辅助激光解析电离飞行时间质谱及16S rRNA基因测序鉴定至种水平以筛选皮疽诺卡菌;采用微量肉汤稀释法进行头孢曲松、亚胺培南药敏试验,并分为耐药组与敏感组;对20株耐药菌株进行全基因组测序,通过SMRT Link v5.0.1软件组装基因组,利用GeneMarkS、Repeat Masker、tRNAscan-SE等工具分析基因组特征,结合ARDB、CARD等耐药数据库鉴定耐药基因,并通过PCR验证耐药基因的准确性。结果 共分离鉴定诺卡菌菌株105株,其中皮疽诺卡菌58株(占比55.2%),主要来源于下呼吸道标本(82.8%,48/58)。药敏试验结果显示,58株皮疽诺卡菌对头孢曲松耐药率为65.5%(38/58),对亚胺培南耐药率为41.4%(24/58),最终筛选20株对2种药物均耐药的菌株用于测序。测序结果显示,基因组N50均值为125.6 kb,平均测序深度为50.2×,共预测编码基因均值为6 320个,重复序列占比均值为3.2%,鉴定出ncRNA(tRNA、rRNA、sRNA)均值为128个,基因岛均值为18个。耐药基因分析显示,所有20株耐药菌株携带blaFAR-1基因(编码A类β-内酰胺酶),18株携带RbpA、MtrA、vanR-O基因簇;PCR验证显示,blaFAR-1基因与头孢曲松耐药表型符合率为100.00%(20/20),RbpA/MtrA/vanR-O基因簇与亚胺培南耐药表型符合率为90.00%(18/20)。结论 皮疽诺卡菌对头孢曲松、亚胺培南耐药率较高,blaFAR-1基因是其对头孢曲松耐药的关键基因,RbpA/MtrA/vanR-O基因簇可能参与亚胺培南耐药机制;全基因组测序可有效解析皮疽诺卡菌耐药基因特征,为临床精准选择β-内酰胺类药物提供分子依据。
目的 初步评估华支睾吸虫41.5 kDa重组半胱氨酸蛋白酶(recombinant Clonorchis sinensis cysteine protease, rCsCP)的免疫保护效果及其作为疫苗候选分子的潜力。方法 采用大肠埃希菌BL21系统表达去除信号肽的41.5 kDa rCsCP蛋白,将纯化后的蛋白联合弗氏佐剂免疫BALB/c小鼠,同时设置PBS组和PBS+弗氏佐剂组做对照。每2周免疫1次,共免疫3次,于每次免疫前及末次免疫2周后鼠尾采集血清,酶联免疫吸附试验(ELISA)检测特异性IgG及其亚类(IgG1/IgG2a)抗体效价。末次免疫2周后感染华支睾吸虫囊蚴,分别于感染后0、2、4周取肝组织进行苏木精-伊红(HE)染色、Masson三色染色及免疫组化,并分离脾细胞检测培养上清中干扰素-γ(interferon-γ, IFN-γ)、白细胞介素-2(interleukin-2, IL-2)、IL-4和IL-10的水平。结果 rCsCP免疫后特异性IgG、IgG1及IgG2a抗体滴度持续上升,末次免疫2周后IgG抗体滴度达1∶25 600,且以IgG1为主。HE、Masson染色显示,与PBS组和PBS+弗氏佐剂组相比,rCsCP免疫组小鼠肝组织炎症细胞浸润和胆管周围胶原沉积显著减轻(P<0.005);免疫组化染色显示,rCsCP免疫组小鼠肝组织α-平滑肌肌动蛋白和I型胶原蛋白表达降低(P<0.005)。细胞因子检测表明,末次免疫后两周(即感染0周),rCsCP免疫组IFN-γ、IL-2和IL-10分泌水平相比PBS组和PBS+弗氏佐剂组显著升高(P<0.05),感染后迅速下降;而IL-4自感染第2周起持续上升,至第4周时较PBS组和PBS+弗氏佐剂组升高逾20倍(P<0.005),提示rCsCP诱导了以Th2为主的Th1/Th2混合型免疫反应。结论 41.5 kDa rCsCP免疫可显著减轻华支睾吸虫感染所致的肝脏炎症及纤维化损伤,其保护机制可能与诱导高滴度特异性抗体及以Th2为主的Th1/Th2混合免疫反应相关。
目的 了解海南省五指山市大劣按蚊密度的长期季节性变化特征,分析其与气象因素、归一化差分植被指数(NDVI)和土地利用方式等环境因素间的关系,为疟疾再传播风险防控提供依据。方法 系统收集2001—2024年海南省五指山市毛阳镇监测点疟疾媒介大劣按蚊密度监测数据,结合气象资料、NDVI和土地利用等数据,首先对五指山市大劣按蚊密度的季节性特征进行描述性分析,利用Spearman相关性分析方法分析环境因素对大劣按蚊密度的影响,再采用分布滞后非线性模型(DLNM)分析重要环境因素对大劣按蚊密度的非线性滞后影响。结果 2001—2024年五指山市大劣平均密度为0.66只/d,高峰出现在3—6月,2020年5月出现异常高值3.83只/d。Spearman相关性分析显示,大劣按蚊密度与月平均最低气温(rs=0.40,P<0.001)、最高气温(rs=0.31,P<0.001),平均气温(rs=0.28,P<0.001)呈显著正相关,与水体比例负相关(rs=-0.39,P<0.001),与森林比例呈弱正相关(rs=0.28,P<0.001),与NDVI无关 (rs=-0.09, P<0.05)。DLNM结果显示,最低气温在18~22 ℃时大劣按蚊密度风险最高,效应主要集中在0~1.5个月;降水0~100 mm时风险升高(RR最高1.46),滞后1~3个月效应突出;NDVI<0.76时风险增加(RR=1.10~1.40)。结论 环境因素与大劣按蚊密度密切相关,其中气温、降雨、NDVI、水体比例对五指山市大劣按蚊密度影响较大,应将上述因素纳入大劣按蚊监测与风险评估体系,为该地区疟疾再传播风险监测提供科学依据。
目的 探讨特发性矮身材(idiopathic short stature, ISS)儿童与正常身高儿童肠道菌群的结构与组成差异,并分析肠道菌群在ISS发生中的潜在作用,为进一步揭示ISS的发病机制及靶向干预提供理论依据。方法 选取2023年1月至2024年7月于中南大学湘雅医学院附属海口医院儿童医学部就诊的22例4.0~7.5岁ISS患者为ISS组,15名同龄正常身高健康儿童为对照组。收集研究对象临床资料及粪便样本,采用16S rDNA测序技术检测并分析肠道菌群的组成特征。结果 ISS组与对照组肠道菌群Alpha多样性差异无统计学意义(P>0.05),Beta多样性差异有统计学意义(R=0.109,P<0.05)。在门水平上,2组的主要菌门均为厚壁菌门(Firmicutes)、拟杆菌门(Bacteroidota)和变形菌门(Proteobacteria)。ISS组以拟杆菌属(Bacteroides,29.72%)、粪杆菌属(Faecalibacterium,10.89%)、大肠埃希菌-志贺菌属(Escherichia-Shigella,5.92%)、考拉杆菌属(Phascolarctobacterium,3.09%)和另枝菌属(Alistipes,2.49%)为主;对照组则以拟杆菌属(26.61%)、粪杆菌属(9.04%)、大肠埃希菌-志贺菌属(4.41%)、双歧杆菌属(Bifidobacterium,2.93%)和巨单胞菌属(Megamonas,2.92%)为主。LEfSe分析显示,科和属水平上ISS组共鉴定出7个优势菌群,对照组共检测到6个优势菌群。在科水平上,ISS组优势菌群为韦荣菌科,对照组为月形单胞菌科、普雷沃菌科、摩根菌科;在属水平上,ISS组优势菌群为韦荣球菌属、噬氢菌属、Hungatella、丹毒丝菌属、颤螺菌属、戴阿利斯特杆菌属,对照组为巨单胞菌属、Subdoligranulum、摩根菌属。属级共现网络分析提示ISS组较对照组简化。结论 ISS儿童的肠道优势菌群与正常儿童显著不同,表现为菌群失调以及炎症反应相关菌群的丰度升高,提示肠道菌群可能在ISS的发生和进展中发挥重要作用。
目的 报告重庆市首例猴痘病毒Ⅰb亚分支确诊病例的流行病学特征、处置过程及传播链,为预防控制猴痘Ⅰb亚分支疫情,特别是为女性感染病例的早期发现和调查处置提供参考。方法 对重庆市2025年8月6日确诊的猴痘病例开展现场流行病学调查,采集病例及接触者的临床样本和环境样本。采用实时荧光PCR进行猴痘病毒核酸检测。结果 病例为25岁外籍留学生,女性,表现为发热、咽痛,手、面部、外生殖器依次出现痘疱疹。病例咽拭子及疱疹液样本经检测,呈猴痘病毒核酸阳性(Ct值20.0),基因测序确认为Ⅰb亚分支。经调查,病例2025年7月15—27日有G省旅居史,期间与一名有皮疹史的男性外籍人员有多次密切接触(亲吻、拥抱等)行为。返渝后,8月1—3日相继出现发热、咽痛等症状;2日自行服药无效;4日出现痘疱疹,前往某医院妇科就诊;6日再次前往该医院皮肤科就诊,采集疱疹液及咽拭子送检。病例住所环境样本4份均为阳性(Ct值28.95~33.90)。判定一般接触者7名,均无继发感染。病例症状较轻,经隔离治疗后康复。结论 本研究报道了重庆市首例猴痘病毒Ⅰb亚分支确诊病例,系通过密切接触传播感染,提示应加强对境外人员及密切接触者的健康监测,提升医务人员对猴痘的识别能力,尤其是非典型传播途径的警惕。
目的 为了解云南地区人副流感病毒2型(human parainfluenza virus type 2, HPIV-2)的遗传变异特征与进化关系,本研究对云南省分离获得的1株HPIV-2毒株(PIV2/Kunming/0621/2024)进行了全基因组测定与分子特征分析。方法 收集2024年云南省流感样病例监测中发现的1例HPIV-2阳性标本,接种恒河猴肾上皮细胞系(Rhesus monkey kidney epithelial cell line, LLC-MK2)细胞并分离病毒,随后观察细胞病变。采用荧光定量PCR进行病毒核酸检测。经磁珠法提取病毒RNA,合成cDNA并建库,采用Illumina MiSeq高通量测序平台进行全基因组测定。使用CLC Genomics Workbench 23.0.1进行序列拼接,以HPIV-2原型株HPIV2/JAP/Toshiba/1990为参照,开展基因组比对与同源性分析,识别关键突变位点;基于MEGA 7.0构建系统进化树,使用NetNGlyc 1.0预测潜在N-糖基化位点。结果 成功分离获得PIV2/Kunming/0621/2024毒株,并获取其完整基因组序列(GenBank登录号:PQ621733)全长15 563 bp,编码6种结构蛋白(N、P、M、F、HN和L),全基因组和HN基因系统发育分析显示,该毒株属于C分支,与2017年北京分离株亲缘关系最近。原型株相比,其HN基因存在31个氨基酸突变,并在316位新增1个潜在N-糖基化位点。其他基因(包括F、NP、P、L、M等)亦检测到多处突变及糖基化位点变化,例如F蛋白增加1个糖基化位点(99位NISA),NP与P蛋白分别出现新的糖基化位点(如485位NPSV,146位NMSQ)。结论 本研究首次报道了云南地区HPIV-2分离株的完整基因组信息,揭示其在多个结构蛋白中的氨基酸突变及糖基化位点变异特征。系统进化分析表明该毒株属于近年来流行的C分支,为我国HPIV-2的分子进化研究及流行监测提供了重要参考依据,亦为后续疫苗研发和功能机制研究奠定了基础。
基孔肯雅病毒(chikungunya virus, CHIKV)是一种通过伊蚊传播的虫媒病毒,近年来在亚洲、非洲及南美洲多地呈现快速传播趋势,多次引发大规模疫情,严重威胁全球公共卫生安全。CHIKV感染的临床表现与登革热、寨卡病毒病等疾病相似,因此准确、快速的诊断技术对于疾病的鉴别与疫情防控具有重要意义。本文综述了CHIKV相关的检测进展,包括实时荧光定量PCR、LAMP、成簇规律间隔短回文重复序列(clustered regularly interspaced short palindromic repeats, CRISPR)辅助检测以及快速诊断试剂等,重点讨论其在灵敏度、特异度及现场应用可行性方面的优势与局限。总结CHIKV的全基因组测序和基因分型等研究成果,阐述不同基因型的流行特征及其在病毒溯源、变异监测与疫苗研发中的价值。
非结核分枝杆菌(nontuberculosis mycobacterium, NTM)引发的人类疾病日益增多,其病症范围从皮肤损伤到全身性疾病不等,且患者预后较差。此类细菌广泛存在于自然环境中,导致人类暴露于该菌的情况极为常见。但对非结核分枝杆菌的准确识别和鉴定以及对该病的诊断治疗仍是当前面临的主要挑战。非结核分枝杆菌病治疗过程复杂,需长期联合使用多种药物,不仅致使治疗成本较高,还常给患者带来不良反应。中医药作为中国的传统医学,在感染性疾病的治疗方面有着悠久的历史和丰富的经验,近年来,对中药的关注越来越多,同时研究资料显示,在治疗非结核分枝杆菌病方面中药具有一定的潜力,能够提高临床疗效,改善患者症状,减轻西药不良反应,逆转NTM 耐药等。本文从NTM病的流行病学特征,耐药现状,抗生素治疗和中医在NTM病治疗方面的应用进行探讨,期望能为临床治疗提供更多的思路与方法,提升对该疾病的治疗水平。
目的 为防止境内外边境地区鼠疫等重大疫情的发生与跨境传播,本研究回顾既往中哈边境鼠疫自然疫源地的发现,以及近来中蒙边境阿尔泰山区首次分离出鼠疫菌事件,为今后监控工作提供参考。方法 以科学技术史的角度,对历史文献进行回顾和分析研究,并结合最新调查数据,对中哈、中蒙边境口岸及周边地区鼠疫的发现、传播风险及预警机制进行研究。结果 2009—2018年中哈、中蒙边境地区已有4个口岸在其周边地区先后发现9个鼠疫阳性点,并在口岸通关区截获鼠、蚤、蜱、蜚蠊、蝙蝠、野生动物类等输入性病媒生物74批27种,边境地区病媒生物携带病原体跨境传播,存在鼠疫等重大疫情传播风险。结论 为应对口岸通关区与边境线区存在的鼠疫自然疫源地等重大传染病跨境传播风险的威胁,需进一步研究阻断疫情跨境传播的先进监控预警识别技术,应用并完善鼠疫等重大传染病5道监控屏障防线的实践与理论,将疫情消灭在境外及边境萌芽状态。