研究报道
陈秋, 唐继霞, 孟娇, 吴胜春, 代义松, 陈醒醒, 周朝敏, 余福勋, 江佳富, 孙毅, 曹务春, 周远忠, 詹琳
目的 了解贵州省罗甸县山区散养山羊体表寄生蜱携带立克次体属细菌的基本特点。方法 采集贵州省罗甸县山区散养山羊体表寄生蜱,单只提取蜱DNA,制备混合DNA样品进行细菌16S rRNA全长扩增子测序,使用 Kraken2 数据库对质控合格的序列进行物种注释分类。每一个物种挑选一条质量最好的序列作为代表性序列,然后利用美国国立生物技术信息中心(NCBI)网站上的基于局部比对算法的搜索工具(BLAST)评估获得的代表性序列与立克次体属序列的一致性。根据基因一致性分析结果选择与NCBI上注册的立克次体属基因一致性最高的代表性序列和其他立克次体同属种序列,并以立克次体科下的东方体属(Orientia)作为外群,通过MEGA 7.0软件构建系统发育树。结果 共采集66只蜱,其中63只为长角血蜱,3只为微小扇头蜱。本次共获得499条代表性序列,经BLAST比对发现共有21条代表性序列与NCBI核酸数据库中立克次体属细菌16S rRNA的基因一致性在85%以上,其中9条序列与分离自我国的立克次体属(KU758903和KY433580)的基因一致性>89%,OTU47与KU758903的基因一致性最高,为95.76%; 有6条序列与分离自我国和日本的立克次体属(LC388776和MT434769)的基因一致性>90%,有3条与分离自我国河南省的立克次体属中的立克次体共生菌(KY617772)的基因一致>89%; 有2条序列与分离我国山东省的立克次体属中日本立克次体(MF496167和MF496155)的基因一致性>85%,有1条序列与分离自比利时的立克次体属中的Rickettsia vini的基因一致性>85%。遗传进化分析提示本研究发现的立克次体属(OTU47)与分离自中国的未定种立克次体(基因登录号:KU758903)属于同一分支,与分离自中国云南的长角立克次体(基因登录号:KY433580)也位于同一分支,遗传进化关系较近。结论 贵州罗甸县散养山羊体表寄生蜱携带多为未定种的立克次体属细菌,其致病性及公共卫生意义还待进一步研究。